Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC5B-201ENST00000276570 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SMCO2-201ENST00000298876 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 OR10G4-201ENST00000320891 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TDGF1P4-201ENST00000401555 520 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 U3.34-201ENST00000408198 212 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SMCO2-202ENST00000416383 1272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 Z74696.1-201ENST00000428208 1123 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL589990.1-201ENST00000432210 592 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC019055.1-201ENST00000432822 443 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CLUHP5-201ENST00000438421 774 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPL15P1-201ENST00000439981 600 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RNF216-IT1-201ENST00000443837 337 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP54-201ENST00000454001 886 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM3A-206ENST00000484602 1046 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02021-203ENST00000514145 569 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC091175.1-201ENST00000522168 572 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MTND6P20-201ENST00000522986 418 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RASSF8-AS1-204ENST00000535436 1121 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AP002383.5-201ENST00000542623 1161 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC137767.1-202ENST00000543072 752 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-P-207ENST00000568192 747 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC004224.2-201ENST00000574423 529 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC125421.2-201ENST00000580370 583 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 JPT1-211ENST00000581874 517 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC138761.2-201ENST00000583878 343 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC011444.4-201ENST00000586415 418 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF493-205ENST00000596302 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.46-201ENST00000611137 251 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC048380.3-201ENST00000623145 796 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC244517.10-201ENST00000624396 548 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL158175.1-201ENST00000634327 1127 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC114786.2-201ENST00000510090 1426 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 FGL1-203ENST00000398054 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NOS2P3-202ENST00000458685 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AL135818.1-202ENST00000554096 1740 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms