Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 LINC00489-201ENST00000457816 543 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AMPD3-202ENST00000396553 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 ERC1-213ENST00000543086 9241 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 LINC01132-201ENST00000437601 3793 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 LINC02128-205ENST00000641755 1334 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 NUDT13-203ENST00000372997 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 FTH1P7-201ENST00000450676 552 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AF279873.3-204ENST00000523336 784 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC005863.1-201ENST00000379640 2998 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 EPHA1-AS1-202ENST00000429289 5018 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 MAPK10-228ENST00000512689 2583 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 TRPM3-203ENST00000358082 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CABP2Q9NPB3 TRPM3-213ENST00000396285 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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