Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 CT45A9-202ENST00000620704 1010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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