Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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