Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
CNGB1Q14028 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms