Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 525.1 ms