Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK2Q13002 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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