Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NPRL3Q12980 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms