Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC138866.1-201ENST00000514522 497 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SULT1C4-202ENST00000409309 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms