Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 WDR31-201ENST00000341761 4862 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 WDR31-202ENST00000374193 4878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 GREB1L-201ENST00000269218 5600 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 ZBTB39-201ENST00000300101 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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CENPFP49454 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 ARHGEF7-203ENST00000375723 4957 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CENPFP49454 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CENPFP49454 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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