Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXC13P31276 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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