Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
USP35Q9P2H5 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms