Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 HYDIN-209ENST00000538248 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENPP4-201ENST00000321037 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD36-214ENST00000447544 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 BLOC1S5-TXNDC5-201ENST00000439343 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 NELL2-203ENST00000429094 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRINP2-201ENST00000361539 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS16-202ENST00000380445 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTNL2-201ENST00000374993 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108062.1-203ENST00000511497 2012 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 RCAN1-208ENST00000482533 2686 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIA-201ENST00000263369 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYL5-201ENST00000400159 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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KRTAP9-4Q9BYQ2 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 STK16-205ENST00000409743 1069 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC48A1-202ENST00000442892 1024 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AC245884.7-201ENST00000514037 356 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011444.4-201ENST00000586415 418 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AFMID-210ENST00000589256 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIA-203ENST00000594436 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359747.1-202ENST00000606028 918 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 ORAI1-201ENST00000611718 852 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.186-201ENST00000617234 362 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 pRNA.4-201ENST00000620973 89 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MED15P6-202ENST00000621415 787 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC244226.1-201ENST00000631943 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF805-202ENST00000414468 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTFR1L-210ENST00000474295 1873 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL160286.1-201ENST00000427215 2471 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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