Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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RTL8BQ17RB0 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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RTL8BQ17RB0 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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RTL8BQ17RB0 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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RTL8BQ17RB0 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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RTL8BQ17RB0 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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