Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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