Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TAF1AQ15573 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.7 ms