Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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ITGA9Q13797 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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ITGA9Q13797 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ITGA9Q13797 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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