Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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ITGB3BPQ13352 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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ITGB3BPQ13352 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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ITGB3BPQ13352 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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ITGB3BPQ13352 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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