Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 FOXG1-AS1-203ENST00000551395 602 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CBLN2-203ENST00000581073 537 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LTBRP36941 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RXFP1-207ENST00000470033 2175 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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