Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms