Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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PTPRMP28827 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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PTPRMP28827 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
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PTPRMP28827 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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PTPRMP28827 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
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PTPRMP28827 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
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PTPRMP28827 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
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PTPRMP28827 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPRMP28827 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.97
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PTPRMP28827 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
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PTPRMP28827 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC115837.1-201ENST00000517662 1001 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRMP28827 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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