Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSCO60682 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MSCO60682 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms