Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
TM6SF1Q9BZW5 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms