Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGF29Q96ES7 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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