Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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RAB6CQ53S08 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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RAB6CQ53S08 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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RAB6CQ53S08 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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RAB6CQ53S08 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RAB6CQ53S08 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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