Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NRF1Q16656 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms