Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AGTPBP1-202ENST00000357081 4393 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MTTP-208ENST00000511045 3154 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ZNF19-201ENST00000288177 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CCRL2-204ENST00000400882 1642 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms