Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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SS18Q15532 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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SS18Q15532 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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SS18Q15532 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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SS18Q15532 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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SS18Q15532 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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SS18Q15532 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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