Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RAB39AQ14964 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms