Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CHD4Q14839 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
CHD4Q14839 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms