Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
GTF2H3Q13889 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms