Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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TCIRG1Q13488 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
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TCIRG1Q13488 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
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TCIRG1Q13488 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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