Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMAN2Q12907 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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