Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ACADSBP45954 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms