Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
HOXD8P13378 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TMPRSS11D-201ENST00000283916 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
HOXD8P13378 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms