Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RN7SL869P-201ENST00000497032 300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 PDCD6IPP2-205ENST00000565892 498 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 EEF1A1P4-201ENST00000359165 1405 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
UBXN4Q92575 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms