Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 IL15-207ENST00000514653 1388 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 PF4V1-201ENST00000226524 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 TMIGD1-201ENST00000328886 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 OR2T4-201ENST00000366473 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 OR2T4-202ENST00000366475 1047 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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ANKRD39Q53RE8 AC010998.1-201ENST00000414774 943 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ANKRD39Q53RE8 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ANKRD39Q53RE8 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ANKRD39Q53RE8 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-29-201ENST00000520084 244 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC022733.1-201ENST00000521257 739 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SNRPCP5-201ENST00000531775 189 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC089984.2-201ENST00000550293 1201 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AL136018.1-201ENST00000557736 636 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC023906.5-201ENST00000558607 635 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 ZNF213-AS1-208ENST00000575139 530 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC113189.3-201ENST00000576615 330 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 RN7SL716P-201ENST00000580539 268 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SUPT4H1-204ENST00000580947 574 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 RN7SL557P-201ENST00000581047 286 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AP006565.1-201ENST00000581117 586 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ANKRD39Q53RE8 AC010385.2-201ENST00000603743 490 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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