Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
BBS9Q3SYG4 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL591846.2-201ENST00000425161 358 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BBS9Q3SYG4 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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