Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms