Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 RN7SL869P-201ENST00000497032 300 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 TMEM150C-203ENST00000508701 566 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC111000.1-201ENST00000514545 713 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 GZMB-205ENST00000526004 819 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AP001782.1-202ENST00000527774 445 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AL132712.1-201ENST00000555967 582 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AL021807.1-201ENST00000607175 565 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 UPP2-201ENST00000005756 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FXNQ16595 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 SYTL2-228ENST00000533892 1441 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 FGG-204ENST00000405164 1539 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 LEMD1-202ENST00000367151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 LEMD1-204ENST00000367153 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 IMPG1-203ENST00000369963 868 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 LEMD1-206ENST00000391936 727 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 CASK-AS1-201ENST00000451126 515 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 C1orf112-208ENST00000496973 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC243972.1-201ENST00000542992 570 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
FXNQ16595 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms