Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MAPK10-279ENST00000641157 2449 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 KRT23-202ENST00000436344 1485 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MAPK10-354ENST00000641823 2732 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 TMPRSS11D-201ENST00000283916 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC019055.1-201ENST00000432822 443 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 OR2M3-201ENST00000456743 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AL109918.1-201ENST00000602367 3039 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AC106869.1-203ENST00000419035 1892 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
CCDC85BQ15834 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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