Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
COL4A6Q14031 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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COL4A6Q14031 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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COL4A6Q14031 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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