Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EIF4EBP1Q13541 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms