Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF1Q12946 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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