Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ALPK1-205ENST00000504176 5203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 PRLR-211ENST00000511486 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 XIST-211ENST00000635841 1734 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AP002957.1-203ENST00000526091 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 MTCL1-207ENST00000518815 3963 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 LINC00909-202ENST00000580048 3463 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 SPATA31E1-201ENST00000325643 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 LIPC-201ENST00000299022 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 PKP1-202ENST00000352845 2244 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AMMECR1L-202ENST00000393001 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 CDC42SE1-202ENST00000439374 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 SEMA6A-212ENST00000513137 3640 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AC016526.3-201ENST00000624275 3931 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 SAT2-201ENST00000269298 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 APOL4-201ENST00000328429 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RPS10-202ENST00000344700 650 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RNA5SP488-201ENST00000364942 116 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AC064847.1-201ENST00000403125 506 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RPL12P47-201ENST00000406185 127 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RN7SKP172-201ENST00000411341 298 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AL136528.2-201ENST00000416554 351 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AP000529.1-201ENST00000417657 1123 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 TMEM256P2-201ENST00000440241 341 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AL357079.1-202ENST00000445226 294 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AC104212.1-201ENST00000472088 613 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 ATXN7L1-208ENST00000478915 1115 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 OCIAD1-210ENST00000506801 571 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 DUX4L51-201ENST00000508172 1109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 KCTD21-AS1-202ENST00000523626 555 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 ELOB-205ENST00000572954 331 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RN7SL712P-201ENST00000579354 308 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 KRTAP7-1-201ENST00000621162 721 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RNASEH2B-AS1-209ENST00000631080 1707 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AC040162.3-201ENST00000572067 3907 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 TRIM51JP-201ENST00000443564 1320 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 CES5A-206ENST00000521992 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 MID1-211ENST00000610939 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 SCML2-201ENST00000251900 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 TIGIT-206ENST00000486257 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 STAU2-215ENST00000521727 3953 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 CD207-201ENST00000410009 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 SOX9-AS1-204ENST00000434703 3032 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 IDO1-207ENST00000522495 1709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 ARMC4-201ENST00000305242 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 TCP11L1-202ENST00000432887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 CLDN1-201ENST00000295522 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 OR8B4-201ENST00000356130 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 ADAMTS4-202ENST00000367996 9773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RNA5SP207-201ENST00000390874 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 REG3A-202ENST00000393878 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 ZNF175-202ENST00000436511 488 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CACNB1Q02641 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms