Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 DTNA-220ENST00000590831 847 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL158151.4-201ENST00000600965 507 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 7SK.12-201ENST00000612820 244 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC099811.5-201ENST00000617211 819 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC245028.3-201ENST00000618197 285 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 GPR182-201ENST00000300098 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN31-202ENST00000396838 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CCDC77-203ENST00000422000 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC091940.1-204ENST00000507318 3091 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 NYAP2-201ENST00000272907 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ESR1-206ENST00000427531 5436 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC073367.1-201ENST00000421480 697 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC098828.1-201ENST00000436164 440 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL122013.1-201ENST00000473054 801 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC107385.1-201ENST00000507985 778 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AP000879.2-201ENST00000530525 497 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 GNPTAB-203ENST00000549165 373 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ACP5-208ENST00000590420 301 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC008738.6-201ENST00000604605 569 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 FAM74A6-203ENST00000615956 481 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CU638689.4-203ENST00000625185 785 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 PTPRD-AS1-201ENST00000430766 1959 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 SERPINB8-202ENST00000353706 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 C15orf41-214ENST00000569302 1325 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 TMEM45A-201ENST00000323523 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TRIM35Q9UPQ4 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 HAVCR1-205ENST00000523175 1449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DAZ2-207ENST00000382449 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SMCP-201ENST00000368765 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL132671.1-201ENST00000415736 308 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC004160.2-201ENST00000425837 563 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 Z98752.2-201ENST00000432727 312 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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