Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 LINC00632-203ENST00000602535 723 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 RPS2P25-201ENST00000467247 580 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
VAX2Q9UIW0 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms