Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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