Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
TCOF1Q13428 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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TCOF1Q13428 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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TCOF1Q13428 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
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TCOF1Q13428 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
TCOF1Q13428 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
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