Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SRSF5Q13243 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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